コンテント・プロファイルレーン 設定ダイアログ です。
Basis:
- Height入力フィールド:レーン の高さを設定します(単位 ピクセル)
- Typeプルダウンメニュー:登録されている プロファイル を選択するためのメニューです。
- 入力フィールドおよびRef…ボタン:Type として「Import Map Data」が選択された場合にそのファイル名を 絶対パス 付で指定します。あるいは、Ref…ボタン で ファイル選択ダイアログ を表示し、ファイルを選択します。
- Backgroundカラーボックス:プロファイルレーン の 背景カラー を設定します。
Graph Scale:
- Auto ラジオボタン:グラフの 最大値、最小値、および 中央値 を自動設定します。
- Custo mラジオボタン:グラフの 最大値、最小値、および中央値 を手動で設定します。
Sliding Window Parameters:
スライディングウィンドウのパラメータを設定します。
- Fixed ラジオボタン:オンにすると右側の 入力フィールド に数値を入力できるようになります。
- Window Size in bp 入力フィールドには、スライディングウィンドウ の ウィンドウサイズ を 塩基数 で指定します。
- Step Size in bp 入力フィールドには、スライディングウィンドウ の ステップサイズ を 塩基数 で指定します。
- Proportional ラジオボタン:オンにすると右側の 入力フィールド に数値を入力できるようになります。
- Window Size in ratio 入力フィールドには、スライディングウィンドウ の ウィンドウサイズ を カレントゲノム配列 の 全塩基長 に対する比率で指定します。
- Step Size in ratio 入力フィールドには、スライディングウィンドウ の ステップサイズ を カレントゲノム配列の 全塩基長 に対する比率で指定します。
Thin Out:
プロファイル を描画するための線分が同じ位置に重なって描画される場合などに描画を 間引く ためのパラメータです。
- Max ラジオボタン:オンにすると、同じ位置にある数値中で 最大値 のみを描画します。
- Min ラジオボタン:オンにすると、同じ位置にある数値中で 最小値 のみを描画します。
- Average ラジオボタン:オンにすると、同じ位置にある数値の 平均値 を描画します。
- Color:数値は 中央値 より大きな値と、小さな値に分けてそれぞれ別のカラーで表示できます。中央値 より大きな数値は、中央線 から出て、その値までに 棒グラフ で描画されます。中央値 より小さい数値は、中央線 から下向きの 棒グラフ で描画されます。
- Color for Lower Value below the Center Line カラーボックス:中央値 より小さな数値の 棒グラフ のカラーを指定します。
- Color for Upper Value beyond the Center Lineカラーボックス:中央値 より大きな数値の 棒グラフ のカラーを指定します。