IMC では、Excel Format で記述されたゲノムスケールモデルをロードすることができます。
現在のところ、Excel 97-2003 Book Format (*.xls)のみ使用できます。
近日中に、Excel Book Format (*.xlsx)にも対応する予定です。
フォーマット仕様:
Excel 97-2003 Book Format (*.xls)で作成します。
3シート構成で、各シート名をそれぞれ rxns, mets, comps とします。
次回Version Upでgroupsシートが追加されます。groupsシートはオプションとなる予定です。
各シートの1行目はヘッダーとして使用します。
rxns シート
1カラム目:rxnID
2カラム目:rxnName
3カラム目:rxnFormula
4カラム目:rxnECNumber
mets シート
1カラム目: metID
2カラム目:metCompartment
3カラム目:metName
comps シート
1カラム目:compID
2カラム目:compName