パンゲノムからコアゲノムを抽出します。

準備

カレントメインフィーチャーマップに１つのゲノムをロードします。

カレントレファレンスフィーチャーマップに比較する複数のゲノムをロードします。

 

操作 

メニューから　Genome Analysis -> Compare -> Core Genome Analysis…を選択します。

Core Genome Analysis Setting ダイアログが表示されます。

カレントレファレンスフィーチャーマップにロードされているゲノムのリストが表示されています。

比較するゲノムにチェックします。

「Run」をクリックします。

実行設定ダイアログが表示されます。

実行パラメータを変更する場合は、Show Parameter　ボタンをクリックして、パラメータを表示します。

「はい（Y)」をクリックします。

実行が開始され、実行中は進捗メッセージが表示されます。

ゲノム数が多い場合は、時間がかかります。

実行が終了すると、Core Genome Analysis 結果ダイアログが表示されます。

ダイアログのある1行をクリックすると、相同遺伝子がアラインメントされます。

各行のAlignmentボタンをクリックします。

確認メッセージ（Start Multiple Alignment)が表示されます。

「はい（Y)」をクリックします。

Multiple Alingnment 描画ダイアログが表示されます。