ゲノム配列 上の 制限酵素認識部位 を見つけます
ゲノム塩基配列ファイルを読み込みます- サンプルデータ をインストールしてある場合は、RE_Fragmentsディレクトリの「Bsub_50kb.gbk」を読み込みます
- Bsub_50kb.gbk のフィーチャーマップが表示されます
- この塩基配列上の 制限酵素認識部位 を検索します。
- 「RE Recognition」ボタンをクリックします。あるいは、メニューから Cloning -> Restriction Enzyme を選択します。
- 「Enzyme Selection」Dialog が表示されます。
「Select All」ボタンをクリックします。- すべての制限酵素にチェックが付加されます。
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- 「Show Recognition Site」ボタンをクリックします。
- 「Recognition Site」Window が表示されます。左側には制限酵素名と認識部位の数がリストされます。
- いくつかの制限酵素にチェックをつけます。
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- 右側にそれらの制限酵素の全認識部位がリストされます。
- 一つの行をクリックします。
- メインフィーチャーマップの配列レーンが自動的にスクロールし、その制限酵素認識配列を示します。
- 制限酵素認識配列はカラー表示され、切断部位も表示されます。
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- Digestion をクリックします。
- 実行確認メッセージが表示されます。
- 「はい(Y)」をクリックします。
- Digestion List ダイアログが表示されます。
- チェックします。
- Loadをクリックします。
- 断片がメインカレントディレクトリにロードされ、完了確認メッセージが表示されます。
- OKをクリックします。
- メインカレントディレクトリの最後に断片配列がロードされています。