必要データ
- カレントゲノム配列(1個以上のCDSの登録が必要)
- 宿主ゲノムのコドン使用頻度表ファイル(DNAコドンにします、RNAコドンはエラーになります)
- 使用する制限酵素情報
操作方法
- Main Treeから組み換えに使用するDNA断片ファイルをクリックし、カレントゲノム配列にします。
- カレントゲノム配列多くのCDSが登録されている場合は、実行時間がかかります。
- 組換えDNAにはCDSアノテーションが必要です。
- メニューから GENOME DESIGN > Change Codon をクリックします。
- コドン置換ダイアログが表示されます。
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- 使用する制限酵素を選択します。
- 使用する制限酵素がリストにない場合は、CLONING> RestrictionEnzymeで追加します。
- 宿主ゲノムのコドン使用頻度表ファイル(*.csv)を指定します。
- Run (Design)ボタンをクリックします。
- 設計実行中は、プログレスメッセージが表示され、終了すると自動的に閉じます。
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- 設計結果がコドン置換結果ダイアログに表示されます。