ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

インシリコバイオロジー株式会社 公式技術情報サイト

IMC S11B 宿主ゲノムの組成に適合したインサートDNA断片のコドン置換

必要データ

  • カレントゲノム配列(1個以上のCDSの登録が必要)
  • 宿主ゲノムのコドン使用頻度表ファイル(DNAコドンにします、RNAコドンはエラーになります)
  • 使用する制限酵素情報

操作方法

  1. Main Treeから組み換えに使用するDNA断片ファイルをクリックし、カレントゲノム配列にします。
    • カレントゲノム配列多くのCDSが登録されている場合は、実行時間がかかります。
    • 組換えDNAにはCDSアノテーションが必要です。
  2. メニューから GENOME DESIGN > Change Codon をクリックします。
  3. コドン置換ダイアログが表示されます。
    •  IMC8117 249 0172
  4. 使用する制限酵素を選択します。
    • 使用する制限酵素がリストにない場合は、CLONING> RestrictionEnzymeで追加します。
  5. 宿主ゲノムのコドン使用頻度表ファイル(*.csv)を指定します。
  6. Run (Design)ボタンをクリックします。
  7. 設計実行中は、プログレスメッセージが表示され、終了すると自動的に閉じます。
    •  IMC8117 249 182
  8. 設計結果がコドン置換結果ダイアログに表示されます。
    • IMC8117 249 186

Site Seal