IMC F01 GenBank/EMBL Viewerの機能と操作

GenBank/EMBL ビューアは、メインカレント配列ファイル の内容を表示するウィンドウです。

  • メインフィーチャーマップ と連動しており、マップ上の フィーチャー をクリックするとそのフィーチャーが記述されている箇所を表示します。
  • 逆に、GenBank/EMBLビューア上の任意のフィーチャー記述をクリックすると、メインフィーチャーマップ が移動し、その フィーチャー がマップの中央となるように表示します。
  • 任意の 配列行 をクリックすると、同様に フィーチャーマップ が移動し、その位置を表示します。

操作方法

  1. メインカレントディレクトリ に GenBank あるいは EMBL フォーマットの ゲノム塩基配列 をロードします。
  2. メインフィーチャーマップ にその ゲノム配列 の フィーチャーマップ が表示されます。
  3. メニューからView -> GenBank/EMBL Viewer…をクリックします。
  4. GenBank/EMBL Viewerが表示されます。
  5. Viewer には、ロードされたファイルの内容がそのまま表示されます。
  6. スクロール
  7. スクロールバー をドラッグあるいはクリックすることにより、縦スクロールできます。
  8. フィーチャー 位置への移動
  9. GenBank/EMBL Viewer の任意の フィーチャー をクリックします。
  10. そのフィーチャーの記述部分が反転します。
  11. 同時に、メインフィーチャーマップ が移動し、その フィーチャー 記述に対応する フィーチャー が中央に表示され、ハイライトされます。
  12. 逆に、メインフィーチャーマップ 上の任意のフィーチャーをクリックすると、GenBank/EMBL Viewer が自動的にスクロールし、そのフィーチャー記述が反転されて表示されます。
  13. 配列位置への移動
  14. GenBank/EMBLフォーマットファイル の後半には配列領域があります。
  15. 任意の 配列行 をクリックすると、その行が反転表示され、メインフィーチャーマップも自動的にその配列の位置を表示するようにスクロールします。
  16. メインフィーチャーマップ の フィーチャー 以外の任意の位置をクリックしても、GenBank/EMBL Viewer は移動しません。
  17. Viewer のクローズ
  18. GenBank/EMBL Viewer の下部にある「Close」をクリックすると、Viewer が閉じます。
  19. メインカレントディレクトリ の カレントファイル を別の配列に変更することでも Viewer は閉じます。