- 多数の コンティグ に分割されている Multiple GenBank ファイルを1本の連続した Single GenBank 形式塩基配列ファイル に変換します。
- このように1本の塩基配列としておくと、比較ゲノム機能(DotPlot, Venn Diagram, Global Genome Rearrangement Map, Local Genome Rearrangement Map, Gene Cluster Alignment, Core Genome Analysis, Mutation Search, etc)などが使いやすくなります。
操作方法
- メニューからFile->Other Saving -> Save in Join Format を選択します。
- Save File Settingダイアログが表示されます。
- Input フィールドで、Sequence File をオンにします。
- 右側の Ref... をクリックして、編集したい gbkファイル を指定します。
- Output フィールドに出力先のファイル名を フルパス で指定します。
- (Ref...をクリックして、ファイル選択ダイアログ から設定しても構いません)
- Option フィールドで、N Count をオンにします。
- 数値は 100 から 1000 程度
- Save をクリックすると全 コンティグ が間に上記に指定した数値分の N塩基 を挿入して1本の GenBank Format File として結合されます。