ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

変異点解析は近縁種ゲノム（パンゲノム）間の変異点を塩基単位で検出します。

• カレントゲノム配列を基準として、カレント参照ディレクトリにロードされているゲノム配列から複数を選択し比較できます。
• ゲノム配列は遺伝子抽出されCDSフィーチャーが登録されている必要があります。
• 変異塩基をレファレンスフィーチャーマップ上に表示できます。
• 検出部位をCDS上あるいは遺伝子間領域のどちらかに設定できます。
• 遺伝子間領域の場合は精度が落ちます。
• 検出判定基準については、%IdentityおよびOverlap率を変更できます。
• 解析結果画面には変異塩基のリストが表示され、表示項目はゲノム配列別に変異塩基、変異位置、gene name, ocus-Tagとなります。
• 結果はCSV形式でファイル出力できます。メモリーサイズを増やすと、解析可能なパンゲノムサイズも大きくなります。
• 集団が大きい場合は計算時間がかかります。その場合は、コア数の多い計算機で実行することを推奨します。

この機能は以下のソフトウェア・エディションに搭載されています

• IMCGEIMCAEIMCDSGenomeTraveler

実装エディション：IMCGE,AE,DS