Gapped Alignmentの設定について

TsubasaTakahashi
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Gapped Alignmentの設定について

01 3月 2011 04:55

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MetagenomeGAMBLERに実装されていました2bp程度のGapを加えたマッピング（gapped alignment)を実行したいのですが、どうすればよろしいでしょうか？設定方法をお教えください。:huh:

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akr
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Re: GTにはGapped Alignmentはまだ実装されていません。

03 3月 2011 03:44

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回答が遅れて申し訳ありません。

Gapped Alignemt機能は、MGG:MetaGenomeGAMBLERには搭載されておりますが、この処理は実行時間がかなりかかるため、現在のところGTには実装されていません。
処理時間の短縮のための改良が完了した段階で実装する予定です。

GT Developer

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akr
トピック作成者
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Re: Re: Gapped Alignmentの実装予定時期

10 3月 2011 11:23

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Short Read側へのギャップ挿入については、2011年3月末までに実装する予定です。
Reference Gennome側へのギャップ挿入機能については、2011年4月末までに実装する予定です。

GT Developer

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