IMC: GenBankオリジナルファイルのワードラップが変更されてしまう
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IMC: GenBankオリジナルファイルのワードラップが変更されてしまう
14 10月 2010 03:52
オリジナルGenBankファイルに記述されていたWord WrapがIMCに読み込むと変更されてしまうケースがあります。
たとえば、以下のようなケースです。
オリジナル:
(空白20文字)/product="predicted nicotinamide mononucleotide
(空白20文字)transporter"
IMC編集後:
(空白20文字)/product="predicted nicotinamide mononuuleotidetransporter
(空白20文字)"
「2010/10/8 民間企業Aさんからの指摘」を代理投稿しました(フォーラム管理者)
たとえば、以下のようなケースです。
オリジナル:
(空白20文字)/product="predicted nicotinamide mononucleotide
(空白20文字)transporter"
IMC編集後:
(空白20文字)/product="predicted nicotinamide mononuuleotidetransporter
(空白20文字)"
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Re: 特殊文字列「\zx]
13 11月 2010 08:18
IMC Version 4.2.6 において以下の方法で対処しました。
IMCの内部フォーマットでは、qualifier行にある改行は削除せず、文字列「\zx」に置き換えます。
GenBank/EMBLファイル出力の場合には、これを元の改行コードに置き換えます。
IMCのDescription WindowやAnnotation Windowにおいては、改行コードは「\zx」で表示されます。
利用者はこの「\zx」文字列を追加したり、削除したり移動することが可能です。
IMC Developer
IMCの内部フォーマットでは、qualifier行にある改行は削除せず、文字列「\zx」に置き換えます。
GenBank/EMBLファイル出力の場合には、これを元の改行コードに置き換えます。
IMCのDescription WindowやAnnotation Windowにおいては、改行コードは「\zx」で表示されます。
利用者はこの「\zx」文字列を追加したり、削除したり移動することが可能です。
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Re: IMC内部では特殊文字列「\zx」に改行コードを置換え、ファイル出力の際に元の改行コードに戻します。
13 11月 2010 08:19
IMC Version 4.2.4 において以下の方法で対処しました。
IMCの内部フォーマットでは、qualifier行にある改行は削除せず、文字列「\zx」に置き換えます。
GenBank/EMBLファイル出力の場合には、これを元の改行コードに置き換えます。
IMCのDescription WindowやAnnotation Windowにおいては、改行コードは「\zx」で表示されます。
利用者はこの「\zx」文字列を追加したり、削除したり移動することが可能です。
IMC Developer
IMCの内部フォーマットでは、qualifier行にある改行は削除せず、文字列「\zx」に置き換えます。
GenBank/EMBLファイル出力の場合には、これを元の改行コードに置き換えます。
IMCのDescription WindowやAnnotation Windowにおいては、改行コードは「\zx」で表示されます。
利用者はこの「\zx」文字列を追加したり、削除したり移動することが可能です。
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