あなたが使う言語を選んでください

Gene Cluster Alignmentの表示

  • m.machida
  • m.machida さんのアバター トピック作成者
  • 訪問者
  • 訪問者

Gene Cluster Alignmentの表示

19 8月 2018 18:30
#
Gene Cluster Alignmentの表示について、遺伝子の対応関係を線から塗りつぶしに変えていただきまして有り難うございます!
とても見やすくなったと思います。
更にお願いで申し訳ないのですが、以下のURLのFigure 4aのように、塗りつぶしとCDSの間に空白を入れられないでしょうか。
digitalcommons.unl.edu/cgi/viewcontent.c...text=plantpathpapers

この様に表示できると、CDSの色が影響を受けないこと、より美しく見える効果があると思います。
ご検討のほどどうぞよろしくお願い致します。

ログイン は対話に参加してください。

  • m.machida
  • m.machida さんのアバター トピック作成者
  • 訪問者
  • 訪問者

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

19 8月 2018 18:56
#
先ほどのメッセージに関連してもうひとつ提案があります。

塗りつぶし表示によって遺伝子の対応関係がとても見やすくなり、順方向か逆方向かの区別は直ぐに分かるようになりました。
そこで、塗りつぶしの色について、遺伝子間の相同性に基づいて変えることはできないでしょうか。
遺伝子機能による色分け(既存のIMC機能)と合わせて比べることにより、どのような違いが有るかを推定しやすくなると思います。
例えば、「主要代謝パスの遺伝子はほとんど同じで、修飾に関わる遺伝子が違っている」などです。
ご検討のほどどうぞよろしくお願い致します。

m.machida は書きました: Gene Cluster Alignmentの表示について、遺伝子の対応関係を線から塗りつぶしに変えていただきまして有り難うございます!
とても見やすくなったと思います。
更にお願いで申し訳ないのですが、以下のURLのFigure 4aのように、塗りつぶしとCDSの間に空白を入れられないでしょうか。
digitalcommons.unl.edu/cgi/viewcontent.c...text=plantpathpapers

この様に表示できると、CDSの色が影響を受けないこと、より美しく見える効果があると思います。
ご検討のほどどうぞよろしくお願い致します。

ログイン は対話に参加してください。

  • akr
  • akr さんのアバター トピック作成者
  • 訪問者
  • 訪問者

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

19 8月 2018 23:08
#
至急検討いたします。

ログイン は対話に参加してください。

  • akr
  • akr さんのアバター トピック作成者
  • 訪問者
  • 訪問者

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

22 8月 2018 23:58
#
相同性スコアに関連したカラーでの描画機能は、2018年8月22日リリースのIMC Version 7.25に実装されました。

ログイン は対話に参加してください。

  • akr
  • akr さんのアバター トピック作成者
  • 訪問者
  • 訪問者

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

28 8月 2018 15:09
#
2018/8/28 リリースの IMC Version 7.26において、CDSとバンドの間に空白を設けました。
リリースニュースをご覧ください。

ログイン は対話に参加してください。

  • m.machida
  • m.machida さんのアバター トピック作成者
  • 訪問者
  • 訪問者

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

29 8月 2018 07:16
#
どうも有り難うございます!
採れもきれいに描画できました。
まだ色を変えることができていませんがこの後試してみます。

ログイン は対話に参加してください。

ページ作成時間: 0.272 秒
Powered by Kunena フォーラム