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広い領域をカバーする複数のプライマーセットを設計するには?

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広い領域をカバーする複数のプライマーセットを設計するには?

28 Dec 2010 07:55
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ゲノム上の一定の領域を対象として、指定した塩基長のPCR産物が、一定(ユーザ指定)塩基数のオーバーラップをもって、隙間なくカバーするようなプライマーセットを一括設計することはできますか?

例えばWhole genomeを対象に作成したプライマーセットの一部を設計し直したい場合などにこのような機能を利用したいです。

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  • akr
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Re: 現在のWhole Genome PCR Primer Design機能では対応できません

29 Dec 2010 02:40
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現在のWhole Genome PCR Primer Design機能では対応できません。
  1. 全ゲノムの一部領域を指定する機能がありません。
  2. 各PCR産物のOverlap塩基長は指定できまません。

両方とも今後の開発課題に挙げて、なるべく早く実装します。

それまでの間、領域指定については、その領域を切り出した配列を対象にWhole Genome PCR Primer Design機能を使用することで対処可能です。

Overlap塩基長のユーザ指定は現在のところ別の方法でも対処できません。

IMC Developer

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Re: このトピックは移動しました

29 Dec 2010 03:03
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このトピックを「投票箱」から「IMC(質問)」に移動しました。

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