Select your language

Gene Cluster Alignmentの表示

  • m.machida
  • m.machida's Avatar Topic Author
  • Visitor
  • Visitor

Gene Cluster Alignmentの表示

19 Aug 2018 18:30
#
Gene Cluster Alignmentの表示について、遺伝子の対応関係を線から塗りつぶしに変えていただきまして有り難うございます!
とても見やすくなったと思います。
更にお願いで申し訳ないのですが、以下のURLのFigure 4aのように、塗りつぶしとCDSの間に空白を入れられないでしょうか。
digitalcommons.unl.edu/cgi/viewcontent.c...text=plantpathpapers

この様に表示できると、CDSの色が影響を受けないこと、より美しく見える効果があると思います。
ご検討のほどどうぞよろしくお願い致します。

Please Log in to join the conversation.

  • m.machida
  • m.machida's Avatar Topic Author
  • Visitor
  • Visitor

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

19 Aug 2018 18:56
#
先ほどのメッセージに関連してもうひとつ提案があります。

塗りつぶし表示によって遺伝子の対応関係がとても見やすくなり、順方向か逆方向かの区別は直ぐに分かるようになりました。
そこで、塗りつぶしの色について、遺伝子間の相同性に基づいて変えることはできないでしょうか。
遺伝子機能による色分け(既存のIMC機能)と合わせて比べることにより、どのような違いが有るかを推定しやすくなると思います。
例えば、「主要代謝パスの遺伝子はほとんど同じで、修飾に関わる遺伝子が違っている」などです。
ご検討のほどどうぞよろしくお願い致します。

m.machida wrote: Gene Cluster Alignmentの表示について、遺伝子の対応関係を線から塗りつぶしに変えていただきまして有り難うございます!
とても見やすくなったと思います。
更にお願いで申し訳ないのですが、以下のURLのFigure 4aのように、塗りつぶしとCDSの間に空白を入れられないでしょうか。
digitalcommons.unl.edu/cgi/viewcontent.c...text=plantpathpapers

この様に表示できると、CDSの色が影響を受けないこと、より美しく見える効果があると思います。
ご検討のほどどうぞよろしくお願い致します。

Please Log in to join the conversation.

  • akr
  • akr's Avatar Topic Author
  • Visitor
  • Visitor

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

19 Aug 2018 23:08
#
至急検討いたします。

Please Log in to join the conversation.

  • akr
  • akr's Avatar Topic Author
  • Visitor
  • Visitor

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

22 Aug 2018 23:58
#
相同性スコアに関連したカラーでの描画機能は、2018年8月22日リリースのIMC Version 7.25に実装されました。

Please Log in to join the conversation.

  • akr
  • akr's Avatar Topic Author
  • Visitor
  • Visitor

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

28 Aug 2018 15:09
#
2018/8/28 リリースの IMC Version 7.26において、CDSとバンドの間に空白を設けました。
リリースニュースをご覧ください。

Please Log in to join the conversation.

  • m.machida
  • m.machida's Avatar Topic Author
  • Visitor
  • Visitor

Re: Gene Cluster Alignmentの表示

29 Aug 2018 07:16
#
どうも有り難うございます!
採れもきれいに描画できました。
まだ色を変えることができていませんがこの後試してみます。

Please Log in to join the conversation.

Time to create page: 0.161 seconds
Powered by Kunena Forum
汽水音乐易歪歪HelloGPT易歪歪单机版沙盘纸飞机易翻译比特浏览器mumu模拟器