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IMC: フィーチャーをクリックしてその塩基配列範囲を指定したい

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IMC: フィーチャーをクリックしてその塩基配列範囲を指定したい

19 Oct 2010 07:43
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featureで規定されている場所から、そのほかの場所までを簡単に選択することができない。
例えば、feature map上で、CDSがあり、その場所をクリックして選択し、さらに、別の場所のプライマー(この二つの距離がたとえ5kp離れていても)をシフトを押しながら選択すると、その領域が選択でき、削除、コピーが自由自在にできる!という機能が欲しいです。

「2010/07/27 NS大Iさん」代理投稿しました。- Forum Administrator-

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Re: IMC Version 4.1.31にて実装しました

19 Oct 2010 07:44
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Version 4.1.31でご要望実装しました。

IMC Developer

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Re: この機能で削除は可能ですか?

12 Dec 2010 10:03
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この機能でフィーチャーと配列のコピーはできますが、削除の方法が判りません。

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Re: 現在フィーチャーのみの削除は可能ですが、配列を削除することはできません。

12 Dec 2010 10:05
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上記の機能には、現在配列を含む全削除はありません(指定領域にオーバーラップするフィーチャーのみの削除は可能です)。
配列を含む全削除の場合は、一部オーバーラップするフィーチャーをどのようなフィーチャーキーとするか
取り決める必要があります。そのようなフィーチャーで、source以外はmisc_featureとする方法にしようかと考えています。

IMC Developer

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Re: フィーチャークリックによる指定塩基配列範囲の塩基配列削除機能が追加されました。

21 Jan 2011 10:45
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IMC Version 4.2.15からフィーチャークリックによる指定範囲の塩基配列削除機能が追加されました。
  1. フィーチャーレーン上で操作を行います。
  2. コントロールキーを押しながら、指定したい範囲の左側のフィーチャーをクリックします。
  3. そのまま(コントロールキーを押しながら)、範囲の右端のフィーチャーをクリックします。
  4. 2つのフィーチャーを含む範囲の塩基配列が選択されます。
  5. 選択された範囲の上で、マウス右クリックします。
  6. メニューから「Delete Nucleotide」を選択します。
  7. 選択範囲にある全塩基配列およびその範囲に含まれるフィーチャーが削除されます。
  8. 範囲に一部がオーバーラップするフィーチャーはフィーチャーキーが変更される場合があります。
  9. 以上の処理は、保存ボタンをクリックすると、回復できません。

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