IMCにてblastがアクティブにならない件ですが、
添付資料を参考に以下の2点についてご確認下さい。
1.オプション設定「Homology Seach」タブの「Query Length Settings」の設定項目
「Query Length Settingsはどうのように設定されていますでしょうか?
「Query Length Settings」の設定で「上限値」項目に値が設定されている場合、
その条件外であれば、アクティブにならないようになっています。
2.オプション設定「Commands」タブの「blastall」および「formatdb」設定項目
既に確認済みかも知れませんが、「blastall」および「formatdb」に設定されている
パスに実際にコマンドが存在しているかどうか確認してみて下さい。
IMC Developer