Welcome, Guest Username: Password: Secret Key Remember me Forgot your password? Forgot your username? Forum in silico Forum GenomeTraveler Questions (GT) scaffoldingList のカラムの意味 Page:1 TOPIC: scaffoldingList のカラムの意味 14 years 5 months ago #236 YShiwa Topic Author Online Posts: 15 連結されたコンティグのリスト「scaffoldingList」において、 以下の各カラムの意味は何でしょうか? Order1 Name1 Order2 Name2 Counts 28 contig00032 1280 contig01712 472 Check this box to be notified of replies to this topic. Note: BBcode and smileys are still usable. Please Log in to join the conversation. Re: scaffoldingList のカラムの意味 14 years 5 months ago #237 akr-sp-1212728882 Online Posts: 395 Order1とOrder2は、各Contig配列に自動的に付けられた連番です。 Contig数が10000本あれば、1から順に1ずつ増分され、最後は10000になります。 末尾の1と2はペアエンドでブリッジされた「左側コンティグ=1」と「右側コンティグ=2」を意味します。 Name1とName2は、コンティグの定義行の内容が表示されます。 Countはその2つのコンティグをブリッジしているペアエンドの数を示します。 GT Developer Check this box to be notified of replies to this topic. Note: BBcode and smileys are still usable. The following user(s) said Thank You: YShiwa Please Log in to join the conversation. Last edit: by akr-sp-1212728882. Page:1 Board Categories Forum IMC - Questions from Users (IMC) - Bug and Trouble Reports (IMC) - New and Enhanced Functions (IMC) - User Requests (IMC) - Future Enhancements (IMC) Forum GenomeTraveler - Questions (GT) - Bug and Trouble Reports (GT) - New and Enhanced Functions (GT) - User Requests (GT) - Future Enhancements (GT) General Matter, Unknown or New Product Forum in silico Forum GenomeTraveler Questions (GT) scaffoldingList のカラムの意味 Time to create page: 0.032 seconds Powered by Kunena Forum