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Questions (GT)
GT: Scaffoldを全部直列に結合して、間を指定した個数のN塩基で埋める方法を教えて下さい。
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GT: Scaffoldを全部直列に結合して、間を指定した個数のN塩基で埋める方法を教えて下さい。 14 years 3 months ago #340

  • AgentUser-sp-1336637799
  • AgentUser-sp-1336637799's Avatar Topic Author
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生成されたScaffoldを全部直列に結合して、各Scaffold間を指定した個数のN塩基で埋める方法を教えて下さい。

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Last edit: by AgentUser-sp-1336637799.

以下の手順で実行します。 14 years 3 months ago #341

  • akr-sp-1212728882
  • akr-sp-1212728882's Avatar
  • Online
  • Posts: 395
  1. 生成された全Scaffoldを「新規プロジェクト登録」で複数の染色体として登録します。
  2. メインコントロールウィンドウのNew Projectボタンをクリックします。
  3. Addボタンをクリックして染色体を登録します。
  4. 1個のマルチプルFastA形式のファイルの場合はファイル指定です。
  5. 複数のシングルFastA形式のファイルの場合は、全ファイルが保存されているディレクトリを指定します。
  6. OKボタンをクリックします。
  7. ファイルが読み込まれます。
  8. Select Allボタンをクリックします。
  9. Chosen genome ...にチェックします。
  10. Margin to ...にNの個数を入力します。
  11. Setボタンをクリックします。

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Last edit: by akr-sp-1212728882.
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GT: Scaffoldを全部直列に結合して、間を指定した個数のN塩基で埋める方法を教えて下さい。
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