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Gene Cluster Alignmentの表示 6 years 9 months ago #621

  • m.machida
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Gene Cluster Alignmentの表示について、遺伝子の対応関係を線から塗りつぶしに変えていただきまして有り難うございます!
とても見やすくなったと思います。
更にお願いで申し訳ないのですが、以下のURLのFigure 4aのように、塗りつぶしとCDSの間に空白を入れられないでしょうか。
digitalcommons.unl.edu/cgi/viewcontent.c...text=plantpathpapers

この様に表示できると、CDSの色が影響を受けないこと、より美しく見える効果があると思います。
ご検討のほどどうぞよろしくお願い致します。

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Gene Cluster Alignmentの表示 6 years 9 months ago #622

  • m.machida
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先ほどのメッセージに関連してもうひとつ提案があります。

塗りつぶし表示によって遺伝子の対応関係がとても見やすくなり、順方向か逆方向かの区別は直ぐに分かるようになりました。
そこで、塗りつぶしの色について、遺伝子間の相同性に基づいて変えることはできないでしょうか。
遺伝子機能による色分け(既存のIMC機能)と合わせて比べることにより、どのような違いが有るかを推定しやすくなると思います。
例えば、「主要代謝パスの遺伝子はほとんど同じで、修飾に関わる遺伝子が違っている」などです。
ご検討のほどどうぞよろしくお願い致します。

Gene Cluster Alignmentの表示について、遺伝子の対応関係を線から塗りつぶしに変えていただきまして有り難うございます!
とても見やすくなったと思います。
更にお願いで申し訳ないのですが、以下のURLのFigure 4aのように、塗りつぶしとCDSの間に空白を入れられないでしょうか。
digitalcommons.unl.edu/cgi/viewcontent.c...text=plantpathpapers

この様に表示できると、CDSの色が影響を受けないこと、より美しく見える効果があると思います。
ご検討のほどどうぞよろしくお願い致します。

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Gene Cluster Alignmentの表示 6 years 9 months ago #625

至急検討いたします。

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Gene Cluster Alignmentの表示 6 years 9 months ago #626

相同性スコアに関連したカラーでの描画機能は、2018年8月22日リリースのIMC Version 7.25に実装されました。

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Gene Cluster Alignmentの表示 6 years 9 months ago #627

2018/8/28 リリースの IMC Version 7.26において、CDSとバンドの間に空白を設けました。
リリースニュースをご覧ください。

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Last edit: by akr.

Gene Cluster Alignmentの表示 6 years 9 months ago #628

  • m.machida
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どうも有り難うございます!
採れもきれいに描画できました。
まだ色を変えることができていませんがこの後試してみます。

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