IMC: 塩基配列の平均GC含量を算出（表示）する方法は？

AgentUser
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01 Apr 2011 23:53 #213 by AgentUser

IMC: 塩基配列の平均GC含量を算出（表示）する方法は？ was created by AgentUser

あるゲノムの塩基配列の平均GC含量を算出（表示）する方法を教えてください。

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akr
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02 Apr 2011 00:12 #214 by akr

Replied by akr on topic GenomeAnalyis --> Statisticsを使用します。

対象のゲノム配列のGenBankファイルをIMCにLoadします。
メニューからGenome Analysis --> Statisticsを選択します。
ゲノム配列全体にわたる平均GC含量については、Total あるいはsourceにチェックします。すると右側にゲノム全体の平均GC(%)が表示されます。
フィーチャー別の平均GC含量も表示することができます。
CSVボタンをクリックするとチェックされたフィーチャーの情報がCSVファイルとして出力できます。

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