すでに同定されているCDSがフィーチャーとして登録され、かつ表示設定されていますが、そのアミノ酸配列が配列レーン上に表示されません。

そのCDSにアミノ酸配列が注釈として登録されていないと、配列レーンにアミノ酸コードは表示されません。この場合には、そのCDSをアミノ酸翻訳するとQualfier /translation=以下にアミノ酸配列が生成され、配列レーンの対応するフレームにアミノ酸残基が表示されるようになります。

1個のCDS上にアミノ酸配列を登録する方法：
そのCDS上でマウス右クリックします。
メニューからtranslateを選びます。
適当な遺伝暗号表を選びその番号を指定します。
Setボタンをクリックします。
翻訳が実行され、そのCDSの/translation=にアミノ酸配列が登録されます。この結果、配列レーン上にアミノ酸配列が表示されます。

すべてのCDSの翻訳を一度に実行する方法：
ツールボックスのTranslationボタンをクリックします。

指定領域にあるすべてのCDSの翻訳を一度に実行する方法：
フィーチャーレーン上でその領域をマウスでドラッグし、領域指定します。
選択された領域上で、マウス右クリックします。
表示されたメニューからTranslateを選びます。