インデックス最近のトピック検索 Welcome, Guest Username: Password: Secret Key Remember me Forgot your password? Forgot your username? フォーラム Forum IMC Questions from Users (IMC) IMC: Batch PCR Primer Designについて教えて下さい Questions from Users (IMC) Page:1 TOPIC: IMC: Batch PCR Primer Designについて教えて下さい 14 years 7 months ago #30 akr-sp-1212728882 Topic Author Online Posts: 395 IMCのBatch PCR Primer designについて教えてください. Helpに見つけることができなかったのですが,例えば,bacteriaの全ORFを増幅するプライマーのデザインは可能でしょうか(例えば大腸菌なら遺伝子が4000個なので4000セットのprimerが出力される)? 使用方法もよくわかりません.defaultの条件でファイルを読み込ませて,find primer pairで走らせても,何のprimer pairも得ることができません.どのように使用するのか教えてください. 「T大学Mさんからの質問」代理投稿しました。-Forum Administrator- Check this box to be notified of replies to this topic. Note: BBcode and smileys are still usable. Please Log in to join the conversation. Last edit: by akr-sp-1212728882. 操作方法 14 years 7 months ago #31 akr-sp-1212728882 Topic Author Online Posts: 395 まだヘルプに記載しておらず、申し訳ありません。 まず、Feature Key SearchをCDSについて実行します。 結果をCSVで保存します。 次に、Batch Homology Searchを起動します。 そこで一番上のファイル指定のところで、保存したCSVファイルを指定します。 Find Primerを実行します。 するとCDSを増幅するプライマーセットが設計されます。 IMC Developer Check this box to be notified of replies to this topic. Note: BBcode and smileys are still usable. Please Log in to join the conversation. 結果が表示できません 14 years 7 months ago #32 akr-sp-1212728882 Topic Author Online Posts: 395 defaultの条件で,添付しましたファイルについてprimer designをしたのですが,エラーは表示されないものの結果を得ることができませんでした. 個別の遺伝子を選択し,同じdefault parameterでfind primerを行った場合には,結果が表示されます. ご多忙のところ申し訳ありませんが,どのような原因が考えられますでしょうか?おしえてください. 「2010/08/27 T大学Mさんからの質問」代理投稿しました。-Forum Administrator- Check this box to be notified of replies to this topic. Note: BBcode and smileys are still usable. Please Log in to join the conversation. Last edit: by akr-sp-1212728882. ご報告 14 years 7 months ago #33 akr-sp-1212728882 Topic Author Online Posts: 395 CDS Feature Keyを出力したCSV ファイルを指定して、 添付のパラメータで実行したら、ある程度設計できました。 あまりCDSに近いと類似配列がある場合が多く、設計できない 場合があります。 IMC Developer Check this box to be notified of replies to this topic. Note: BBcode and smileys are still usable. Please Log in to join the conversation. Page:1 Board Categories Forum IMC - Questions from Users (IMC) - Bug and Trouble Reports (IMC) - New and Enhanced Functions (IMC) - User Requests (IMC) - Future Enhancements (IMC) Forum GenomeTraveler - Questions (GT) - Bug and Trouble Reports (GT) - New and Enhanced Functions (GT) - User Requests (GT) - Future Enhancements (GT) General Matter, Unknown or New Product フォーラム Forum IMC Questions from Users (IMC) IMC: Batch PCR Primer Designについて教えて下さい Time to create page: 0.034 seconds Powered by Kunena Forum