ORF別のBlast実行結果のe-valueのデータがすでにありますが、そのスコアの段階別にフィーチャーマップにカラーで表示、反映する方法を教えて下さい。

IMCには、別のサーバ等で実行したBlastの結果をインポートする機能が実装されています。
ただし、Query配列の名称をGenBankファイルのCDS名とリンクさせ、一致させる必要があります。

これを簡単に一致させるためには、以下の方法を使います。

Ａ．IMCで出力した各CDS別のQueryファイルをBlast実行時に指定します。

1. IMCに対象のGenBankファイルをLoadしておきます。
2. メニューからSearch --> FK Searchを選択します。
3. CDSを全部選択し、
4. アミノ酸配列付きで、
5. FastAファイル出力します。

Ｂ．外部サーバでBlast検索を実行します。

1. Ａ４で出力されたファイルをQueryにして、Blastを実行し、結果ファイルを得ます。

Ｃ．IMCにBlast結果ファイルをインポートします。

1. IMCに対象のGenBankファイルをLoadします。
2. メニューからFile --> Importを選択します。
3. ＢのBlast結果ファイルを指定します。
4. Blast検索結果が各CDSに貼りつきます。

Ｄ．Blastスコア範囲毎にカラー識別されたフィーチャーマップを表示します。

1. メニューからOption Setting --> Feature Setting --> Blast Colorタブを選択します。
2. Blastのスコア別のカラー設定を編集します。デフォールトでよければそのままにします。
3. メニューからView --> Show with blast colorを選択します。
4. 各CDSがBlastカラーで描画されます。

Ａ～Ｃは、IMC上でBatch Homology検索を実行すると、一層簡単にできます。