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Contig List を全てのScaffoldに対して自動的に生成して欲しい

  • YShiwa
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11 Jan 2011 17:51 #554 by YShiwa
生成されたScaffoldに含まれるコンティグのリストを見るには、
現状では各Scaffoldを選択して、Contig Listボタンを押す必要があります。

これは手間ですので、全てのScaffoldに対して、ContigListを自動的に生成して欲しいです。

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  • akr
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11 Jan 2011 21:10 #555 by akr
現在の機能であるScaffold Projectノードから起動できるScaffold Viewerには、生成された全Scaffoldのリストとそれをクリックすることにより、以下のようにそれぞれのScaffoldを構成するContigのリストが表示されますが、これでは不十分でしょうか?あるいは、これに加えてCSVファイル出力が必要でしょうか?
http://www.wikiinsilico.org/index.php?GT_ScaffoldViewer

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  • YShiwa
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11 Jan 2011 21:16 #556 by YShiwa
Scaffoldの数が200以上あるので、各Scaffoldに含まれるコンティグを、一度の操作でCSVに出力して頂けると、助かります。

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  • akr
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11 Jan 2011 21:34 #557 by akr
Replied by akr on topic GT今後の開発項目に載せます
ご要望を今後の開発機能にリストアップし、なるべく早いリリースのGT Versionに実装します。

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