macOS 11, 12, 13への対応について

macOS 11, 12, 13 がリリースされていますが、同OSにVersion Upした場合、当社製品関係では以下のトラブルが報告されています。

旧ドングル（Sentinel Hardware Key: SHK)が正常に動作しない。SHKのメーカーの保守が終了しています。

このため、対処方法は以下のいずれかになります。

1. 新ドングルと交換する（2023.4.10から）。現在、SHKをご利用の場合はお問い合わせください。新ドングル(Sentinel HL Key: LDK)と交換いたします（更新期限内は無償です）。
2. macOS 10 に戻す。
3. ドングルライセンスからアクティベーションライセンスに切り替える（無償）。問い合わせください。

新ドングル対応OS Version

• MacOS 10.13, 10.14, 10.15, 11, 12, 13
• Windows 10, 11

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カテゴリー: ドングル関係

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最終更新日:2023年04月19日

参照数: 115970

Mac用Sentinel Hardware Key（ドングル）ドライバーのインストール方法

Mac用Sentinel Hardware Key(ドングル）ドライバーがリリースされましたが、従来のpkg形式ではなく、dmg形式 でした。

この形式の場合、インストール方法は以下の通りです。

1. dmgファイル をダブルクリックします。
2. ドライブ（SentinelSystemDriver-7.5.5)がデスクトップに作成されます。
3. Terminalを開きます。

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   カテゴリー: ドングルライセンス（ハードキー）

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   最終更新日:2020年12月30日

   参照数: 7851

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YD0018 Frame Laneからの新規フィーチャー登録がComplementになってしまう

トラブル・バグ

Frame Lane において、ストップコドン が現れない領域を選択し、マウス右クリック でその領域を 新規フィーチャー として登録する場合に、Forward Strand にあるにもかかわらず、Description Window でその領域が Complement とされてしまう。ただし、Forward Strand の 第3フレーム からの新規登録の場合に生じます。第1，2フレームからの登録は正常に動作します。

当面の対応策

Description Windowで Complement のチェックを解除して登録します。

対応策

バグフィックス Version IMC Ver.7.46 がリリースされました（2020/12/09)。

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カテゴリー: フィーチャーキーの管理と操作

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最終更新日:2020年12月09日

参照数: 6410

IMC T07A Multiple GenBank ファイルをタクソノミー展開する

多数のGanBank形式ファイルから構成されているGBFFファイルを個々のGenBankファイルのTaxonomy記述に従い系統樹状のディレクトリ―に展開し、IMCで取り扱いしやすく配置します。

背景

GenBankやRefSeqの塩基配列データは、リリース時期ごとに大きな圧縮ファイルにまとめられています。

また、個々のエントリーは、ヘッダーファイル（*.gbff)と配列部(*fna)から構成されおり、シングルGenBankファイルとするには、これらの2種類のファイルを結合する必要があります。

GenBank File Expanderは、GenBankやRefSeqのこれらのファイルを解凍し、合成し、任意の場所に系統樹状のディレクトリとして展開します。

この展開されたディレクトリをIMCのルートディレクトリに指定すると、IMCのディレクトリツリーに表示、ロードするとことができます。

操作

メニューから「Tools -> Multiple GenBank File Expander」をクリックします。

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カテゴリー: GenBank GBFF Expander

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最終更新日:2019年02月01日

参照数: 8486

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IMC S411 OGAB法によるクラスター配列断片化設計を実行する

設計した遺伝子クラスターを再構築するために、クラスターを最適に断片化します。

その後、個々の断片を化学合成した後に、各断片をOGAB法により再構成し、長鎖DNAクラスターを作成します。

実装エディション

この機能は、以下のエディションに実装されています。

IMCDS

操作

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カテゴリー: クラスター断片化設計

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最終更新日:2018年12月07日

参照数: 3332

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IMC B2DA03 選択領域を増幅するPCRプライマーを設計する

フィーチャーレーン の選択領域を増幅する PCRプライマー を設計します。

選択領域と設計される プライマー の位置については、2種類の設定が可能です。

1. 選択領域の外側に フォワード・リバースプライマー を設計し、できるだけ プロダクト塩基長 が短くなるようにします。

この場合は、選択範囲の外側に設計できる範囲（黄色で示された範囲）を設定し、それを超える位置には設計できません。

デフォールト値は1000bpで、このパラメータは変更することができます。

２．選択領域の内側に フォワード・リバースプライマー を設計し、できるだけ プロダクト塩基長 が長くなるようにします。

この場合は、最小プロダクト塩基長 を設定し、それ以下の短いプロダクトは設計できません。

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カテゴリー: フィーチャーレーン

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最終更新日:2018年11月05日

参照数: 4419

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IMC W1C IMCの自動インストール手順が変更になりました

IMC Version 7.18から最新Versionのチェック～自動インストールの手順が変更されました

従来

1. 最新Versionのリリースの有無をチェック（IMC起動時に自動チェック設定可）
2. リリースがあった場合は、「ダウンロード確認メッセージ」の表示
3. 最新Versionのダウンロード
4. 最新Versionの自動解凍
5. インストールの確認メッセージ
6. IMCの終了
7. User Access Controlの確認メッセージの表示
8. 自動インストール
9. Java Memoryサイズ設定
10. 完了メッセージと再起動の確認

今回の修正

自動インストールが廃止され、手動でインストールする方法に変わりました。

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カテゴリー: インストール

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最終更新日:2018年07月23日

参照数: 2493