IMC: Batch PCR Primer Designについて教えて下さい
- akr
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13 10月 2010 21:06 #89
by akr
IMC: Batch PCR Primer Designについて教えて下さい was created by akr
IMCのBatch PCR Primer designについて教えてください.
Helpに見つけることができなかったのですが,例えば,bacteriaの全ORFを増幅するプライマーのデザインは可能でしょうか(例えば大腸菌なら遺伝子が4000個なので4000セットのprimerが出力される)?
使用方法もよくわかりません.defaultの条件でファイルを読み込ませて,find primer pairで走らせても,何のprimer pairも得ることができません.どのように使用するのか教えてください.
「T大学Mさんからの質問」代理投稿しました。-Forum Administrator-
Helpに見つけることができなかったのですが,例えば,bacteriaの全ORFを増幅するプライマーのデザインは可能でしょうか(例えば大腸菌なら遺伝子が4000個なので4000セットのprimerが出力される)?
使用方法もよくわかりません.defaultの条件でファイルを読み込ませて,find primer pairで走らせても,何のprimer pairも得ることができません.どのように使用するのか教えてください.
「T大学Mさんからの質問」代理投稿しました。-Forum Administrator-
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- akr
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13 10月 2010 21:07 #90
by akr
Replied by akr on topic 操作方法
まだヘルプに記載しておらず、申し訳ありません。
まず、Feature Key SearchをCDSについて実行します。
結果をCSVで保存します。
次に、Batch Homology Searchを起動します。
そこで一番上のファイル指定のところで、保存したCSVファイルを指定します。
Find Primerを実行します。
するとCDSを増幅するプライマーセットが設計されます。
IMC Developer
まず、Feature Key SearchをCDSについて実行します。
結果をCSVで保存します。
次に、Batch Homology Searchを起動します。
そこで一番上のファイル指定のところで、保存したCSVファイルを指定します。
Find Primerを実行します。
するとCDSを増幅するプライマーセットが設計されます。
IMC Developer
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- akr
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13 10月 2010 21:08 #91
by akr
Replied by akr on topic 結果が表示できません
defaultの条件で,添付しましたファイルについてprimer designをしたのですが,エラーは表示されないものの結果を得ることができませんでした.
個別の遺伝子を選択し,同じdefault parameterでfind primerを行った場合には,結果が表示されます.
ご多忙のところ申し訳ありませんが,どのような原因が考えられますでしょうか?おしえてください.
「2010/08/27 T大学Mさんからの質問」代理投稿しました。-Forum Administrator-
個別の遺伝子を選択し,同じdefault parameterでfind primerを行った場合には,結果が表示されます.
ご多忙のところ申し訳ありませんが,どのような原因が考えられますでしょうか?おしえてください.
「2010/08/27 T大学Mさんからの質問」代理投稿しました。-Forum Administrator-
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