アセンブリ
シーケンサからのリード配列を相同性を用いて互いに結合し、コンセンサス配列を生成します。
NGSからの大規模リードアセンブリとキャピラリーシーケンサからのアセンブリがあります。
NGSリードのアセンブリは、GenomeTravelerにおいて実行できます。
キャピラリーシーケンサからのリードアセンブリは、IMCのツールin silico Assemblerで実行可能です。
ナノポア関連のアセンブリはGenomeTravelerから起動できます。
サブカテゴリ
次世代シーケンサー(NGS)からのリードをアセンブリする機能です。
VelvetとOASESを使用しています。
この機能は以下のエディションに実装されています。
GenomeTravler
Nanopore Seqeuncer からのRead をアセンブルします。
canu および miniasm を使用しています。
この機能は以下のエディションで実行できます。
GenomeTraveler
キャピラリーシーケンサーからのRead のアセンブリ機能です。
この機能は以下のエディションに実装されています。
IMCGE, IMCAE, IMCDS, GenomeTraveler