IMC: 核酸配列を読み込んだら塩基配列が3塩基毎にNが入る配列になってしまいました。
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06 1月 2011 18:21 #402
by AgentUser
IMC: 核酸配列を読み込んだら塩基配列が3塩基毎にNが入る配列になってしまいました。 was created by AgentUser
これまで正しく読めていた核酸配列をIMCに読み込んだら、3塩基毎にNが入るおかしな配列となり、配列数が3倍になってしまいました。
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- akr
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06 1月 2011 18:50 #403
by akr
Replied by akr on topic Auto Format Checkが"A.A."(アミノ酸認識)になっているとそのようになります。
MenuのFile --> Auto Format Checkが"A.A."となっていると、核酸配列をIMCに読み込んでも強制的にアミノ酸配列とみなし、読込時に核酸コードからアミノ酸コードへの逆翻訳が行われます。
この結果、AはGCN, CはTGY、GはGGN、TはACNに置き換えられ、配列数が3倍になります。
この結果、AはGCN, CはTGY、GはGGN、TはACNに置き換えられ、配列数が3倍になります。
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- akr
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11 1月 2011 21:48 #404
by akr
Replied by akr on topic 配列認識機能を"AUTO"か"N.A."にして、再度配列を読み込んでください。
配列認識機能を"Auto"か"N.A."にして、再度配列を読み込んでください。
メインメニューでは、File --> Auto Format Check を "AUTO"か"N.A."に切換えます。
ツールボックスでは、Auto Format Check ボタンをクリックし、"AUTO"か"N.A."に切換えます。
メインメニューでは、File --> Auto Format Check を "AUTO"か"N.A."に切換えます。
ツールボックスでは、Auto Format Check ボタンをクリックし、"AUTO"か"N.A."に切換えます。
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