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IMC: 核酸配列を読み込んだら塩基配列が3塩基毎にNが入る配列になってしまいました。

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07 1月 2011 03:21 #402 : AgentUser
これまで正しく読めていた核酸配列をIMCに読み込んだら、3塩基毎にNが入るおかしな配列となり、配列数が3倍になってしまいました。

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07 1月 2011 03:50 #403 : akr
MenuのFile --> Auto Format Checkが"A.A."となっていると、核酸配列をIMCに読み込んでも強制的にアミノ酸配列とみなし、読込時に核酸コードからアミノ酸コードへの逆翻訳が行われます。
この結果、AはGCN, CはTGY、GはGGN、TはACNに置き換えられ、配列数が3倍になります。

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12 1月 2011 06:48 #404 : akr
配列認識機能を"Auto"か"N.A."にして、再度配列を読み込んでください。
メインメニューでは、File --> Auto Format Check を "AUTO"か"N.A."に切換えます。
ツールボックスでは、Auto Format Check ボタンをクリックし、"AUTO"か"N.A."に切換えます。

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