ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

GTで実行される外部コマンドを登録するためのタブペインです。

CBRC LAST: CBRC で開発された相同性検索ソフトウェアである LAST の実行プログラムが格納されているディレクトリーを指定します。

CBRC SlideSort: CBRC で開発された高速相同性解析ソフトウェアである SlideSort の実行プログラムが格納されているディレクトリーを指定します。

EMBL ClustalW： EBI で開発された ClustalW の実行ファイルを指定します。

EMBL－EBI Velvet： EMBL-EBI で開発された NGS アセンブラー Velvet の実行ファイルを指定します。

EMBL-EBI OASES: EMBL-EBI で開発された NGS アセンブラー OASES の実行ファイルを指定します。

Quality Checker: NGS Read の Quality Check プログラムの実行ファイルを指定します。

NCBI BLAST： NCBI で開発された BLAST の実行ファイルが格納されているディレクトリーを指定します。

NCBI SRA Toolkit： NCBIで開発された SRA Toolkit の実行ファイルが格納されているディレクトリーを指定します。

SAMtoolｓ： SAMtoolsの実行ファイルを指定します。

UWSC ShuffleSeqs： UWSCで開発された ShuffleSeqs の実行ファイルを指定します。

Poretools: Nanopore 用 Poretools の実行ファイルを指定します。

Canu： Nanopore 用アセンブラー Canu の実行ファイルを指定します。

Minimap2： Nanopore 用ソフトウェア Minimap2 の実行ファイルを指定します。

Miniasm： Nanopore 用アセンブラー Miniasm の実行ファイルを指定します。

Racon： Nanopore 用ソフトウェア Racon の実行ファイルを指定します。

GNU Wget for Downloading: ダウンロードに使用される Wget の実行ファイルを指定します。

「Apply」：入力したパラメータを適用します。

「Close]：　入力したパラメータを適用せずに、ダイアログを閉じます。