GT: Scaffoldを全部直列に結合して、間を指定した個数のN塩基で埋める方法を教えて下さい。

AgentUser
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15 2月 2011 23:50 #497 by AgentUser

GT: Scaffoldを全部直列に結合して、間を指定した個数のN塩基で埋める方法を教えて下さい。 was created by AgentUser

生成されたScaffoldを全部直列に結合して、各Scaffold間を指定した個数のN塩基で埋める方法を教えて下さい。

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akr
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16 2月 2011 00:27 #498 by akr

Replied by akr on topic 以下の手順で実行します。

生成された全Scaffoldを「新規プロジェクト登録」で複数の染色体として登録します。
メインコントロールウィンドウのNew Projectボタンをクリックします。
Addボタンをクリックして染色体を登録します。
1個のマルチプルFastA形式のファイルの場合はファイル指定です。
複数のシングルFastA形式のファイルの場合は、全ファイルが保存されているディレクトリを指定します。
OKボタンをクリックします。
ファイルが読み込まれます。
Select Allボタンをクリックします。
Chosen genome ...にチェックします。
Margin to ...にNの個数を入力します。
Setボタンをクリックします。

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