Gapped Alignmentの設定について

TsubasaTakahashi
トピック作成者
訪問者

01 3月 2011 04:55 #499 : TsubasaTakahashi

Gapped Alignmentの設定について \ 作成者TsubasaTakahashi

MetagenomeGAMBLERに実装されていました2bp程度のGapを加えたマッピング（gapped alignment)を実行したいのですが、どうすればよろしいでしょうか？設定方法をお教えください。:huh:

ログインは対話に参加してください。

akr
トピック作成者
訪問者

03 3月 2011 03:44 #500 : akr

GTにはGapped Alignmentはまだ実装されていません。への返信 by akr

回答が遅れて申し訳ありません。

Gapped Alignemt機能は、MGG:MetaGenomeGAMBLERには搭載されておりますが、この処理は実行時間がかなりかかるため、現在のところGTには実装されていません。
処理時間の短縮のための改良が完了した段階で実装する予定です。

GT Developer

ログインは対話に参加してください。

akr
トピック作成者
訪問者

10 3月 2011 11:23 #501 : akr

Re: Gapped Alignmentの実装予定時期への返信 by akr

Short Read側へのギャップ挿入については、2011年3月末までに実装する予定です。
Reference Gennome側へのギャップ挿入機能については、2011年4月末までに実装する予定です。

GT Developer

ログインは対話に参加してください。

ページ作成時間: 0.100 秒

Powered by Kunena フォーラム