Gapped Alignmentの設定について

TsubasaTakahashi
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28 2月 2011 19:55 #499 by TsubasaTakahashi

Gapped Alignmentの設定について was created by TsubasaTakahashi

MetagenomeGAMBLERに実装されていました2bp程度のGapを加えたマッピング（gapped alignment)を実行したいのですが、どうすればよろしいでしょうか？設定方法をお教えください。:huh:

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akr
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02 3月 2011 18:44 #500 by akr

Replied by akr on topic GTにはGapped Alignmentはまだ実装されていません。

回答が遅れて申し訳ありません。

Gapped Alignemt機能は、MGG:MetaGenomeGAMBLERには搭載されておりますが、この処理は実行時間がかなりかかるため、現在のところGTには実装されていません。
処理時間の短縮のための改良が完了した段階で実装する予定です。

GT Developer

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akr
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10 3月 2011 02:23 #501 by akr

Replied by akr on topic Re: Gapped Alignmentの実装予定時期

Short Read側へのギャップ挿入については、2011年3月末までに実装する予定です。
Reference Gennome側へのギャップ挿入機能については、2011年4月末までに実装する予定です。

GT Developer

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