CSVをImportして保存すると、塩基配列がおかしくなる
- YShiwa
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10 1月 2012 00:13 #453
by YShiwa
CSVをImportして保存すると、塩基配列がおかしくなる was created by YShiwa
CSVをImportしてFeatureを追加して保存し、開き直すと、添付の画像のように、塩基配列にNが入りおかしくなってしまいました。
IMGのVersionは、5.0.13Dです。
IMGのVersionは、5.0.13Dです。
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- akr
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10 1月 2012 16:26 #454
by akr
Replied by akr on topic Re: CSVをImportして保存すると、塩基配列がおかしくなる
保存された塩基配列ファイルを読み込むときに、アミノ酸配列として読み込む設定になっていませんか?
"File" メニューの3番目のサブメニューです。これが、"Load Sequence as Nucleotide" あるいは"Auto Format Check.."となっていれば、OKですが、"Load Sequence as Amino Acids" となっていると読み込んだ配列を強制的にアミノ酸配列として認識し、核酸配列に逆翻訳してしまいます。
"File" メニューの3番目のサブメニューです。これが、"Load Sequence as Nucleotide" あるいは"Auto Format Check.."となっていれば、OKですが、"Load Sequence as Amino Acids" となっていると読み込んだ配列を強制的にアミノ酸配列として認識し、核酸配列に逆翻訳してしまいます。
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- YShiwa
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10 1月 2012 16:48 #455
by YShiwa
Replied by YShiwa on topic Re: CSVをImportして保存すると、塩基配列がおかしくなる
FileメニューからAuto Format Checkを選択し、Load Sequence as Nucleotideに変更したら、正常に読み込まれました。ありがとうございます。
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