CSVをImportして保存すると、塩基配列がおかしくなる
- YShiwa
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10 1月 2012 09:13 #453
: YShiwa
CSVをImportして保存すると、塩基配列がおかしくなる \
作成者YShiwa
CSVをImportしてFeatureを追加して保存し、開き直すと、添付の画像のように、塩基配列にNが入りおかしくなってしまいました。
IMGのVersionは、5.0.13Dです。
IMGのVersionは、5.0.13Dです。
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- akr
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11 1月 2012 01:26 #454
: akr
Re: CSVをImportして保存すると、塩基配列がおかしくなるへの返信 by akr
保存された塩基配列ファイルを読み込むときに、アミノ酸配列として読み込む設定になっていませんか?
"File" メニューの3番目のサブメニューです。これが、"Load Sequence as Nucleotide" あるいは"Auto Format Check.."となっていれば、OKですが、"Load Sequence as Amino Acids" となっていると読み込んだ配列を強制的にアミノ酸配列として認識し、核酸配列に逆翻訳してしまいます。
"File" メニューの3番目のサブメニューです。これが、"Load Sequence as Nucleotide" あるいは"Auto Format Check.."となっていれば、OKですが、"Load Sequence as Amino Acids" となっていると読み込んだ配列を強制的にアミノ酸配列として認識し、核酸配列に逆翻訳してしまいます。
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- YShiwa
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11 1月 2012 01:48 #455
: YShiwa
Re: CSVをImportして保存すると、塩基配列がおかしくなるへの返信 by YShiwa
FileメニューからAuto Format Checkを選択し、Load Sequence as Nucleotideに変更したら、正常に読み込まれました。ありがとうございます。
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