CSVをImportすると、Out of memory エラーが出る
- YShiwa
- トピック作成者
- 訪問者
-
25 1月 2012 08:53 #456
: YShiwa
CSVをImportすると、Out of memory エラーが出る \
作成者YShiwa
配列だけのGenbankファイルを開き、CSVをImportするとOut of memoryエラーが発生します。
CSVファイルは5000行程度で、ファイルサイズも400KB程度です。
セキュリティの関係上、このファイルを送って検証して頂くことができないのですが、
何が原因として考えられるでしょうか?
CSVファイルは5000行程度で、ファイルサイズも400KB程度です。
セキュリティの関係上、このファイルを送って検証して頂くことができないのですが、
何が原因として考えられるでしょうか?
ログイン は対話に参加してください。
- akr
- トピック作成者
- 訪問者
-
27 1月 2012 07:53 #457
: akr
Re: CSVをImportすると、Out of memory エラーが出るへの返信 by akr
GenBankファイルには配列以外に定義行などいくつかの必須行が必要です。
「配列だけ」のGenBankファイルとはどのようなファイルでしょうか?
「配列だけ」のGenBankファイルとはどのようなファイルでしょうか?
ログイン は対話に参加してください。
- YShiwa
- トピック作成者
- 訪問者
-
27 1月 2012 08:34 #458
: YShiwa
Re: CSVをImportすると、Out of memory エラーが出るへの返信 by YShiwa
IMCでFastaファイルを開き、SaveでGenbank形式で保存した、Featureがないファイルのことです。
なので定義行はあります。
なので定義行はあります。
ログイン は対話に参加してください。
- akr
- トピック作成者
- 訪問者
-
28 1月 2012 06:26 #459
: akr
Re: CSVをImportすると、Out of memory エラーが出るへの返信 by akr
おそらく、そのCSVファイルのどこかの行が解析できず、変なループに入ってしまったものと思われます。
データは機密ということなので、そのCSVファイルを半分に切断して、落ちる方をさらに半分にするという
バイナリーサーチの方法で、その原因となる箇所を同定します。
また、コマンドプロンプトあるいはターミナルからコマンドラインでIMCを実行すると、より詳しいエラー
メッセージが得られる場合があります。
IMCのトラブル時起動方法は こちら です。
データは機密ということなので、そのCSVファイルを半分に切断して、落ちる方をさらに半分にするという
バイナリーサーチの方法で、その原因となる箇所を同定します。
また、コマンドプロンプトあるいはターミナルからコマンドラインでIMCを実行すると、より詳しいエラー
メッセージが得られる場合があります。
IMCのトラブル時起動方法は こちら です。
ログイン は対話に参加してください。
ページ作成時間: 0.222 秒