あなたが使う言語を選んでください

IMC: Batch PCR Primer Design機能に関する要望

  • akr
  • Topic Author
  • Visitor
  • Visitor
18 10月 2010 23:05 #43 by akr
ようやくbatch primer designを理解することができました.

 それをふまえて,おねがいなのですが,全ORFについて一つ一つprimerをデザインすることが大変なので,

1. 最も良いprimer pairを一括してcsvに書き出して,primerの注文を可能にできないでしょうか?これができると全ORFを用いたcDNAアレイをつくるためのprimer注文,PCRが楽になります.または現在の384サンプル可能なrealtime PCRで全ORFの発現解析が楽になります.候補がない箇所については条件を甘くすれば良いと思うので,その旨を知らせるエラーがでてくれるとありがたいです.
2. ゲノム全体をoverlapするプライマーのデザインをいっかつしてできるようにできたないでしょうか?ゲノムのミスアセンブルの箇所の検出や,Whole genomic scanning PCRが可能になります.genofragというソフトがありますが,ゲノムのどこにハイブリするのか読み込みが現状では手間なので.

「2010/08/30 TI大学Mさんからの要望」代理投稿しました。-Form Administrator-

Please ログイン to join the conversation.

  • akr
  • Topic Author
  • Visitor
  • Visitor
18 10月 2010 23:29 #44 by akr
ゲノム全体をoverlapするプライマーのデザインを一括してできるようになりました。
IMC Version 4.1.36から実装されています。

IMC Developer

Please ログイン to join the conversation.

Time to create page: 0.084 seconds
Powered by Kunena Forum