primer listの表示について
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28 12月 2010 08:06 #18
: DLN
primer listの表示について \
作成者DLN
Primer registration内のPrimer listのところに現在のLength, Tm等に加えてそれぞれのプライマーのpositionが表示されていると助かります。
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- akr
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06 1月 2011 07:56 #20
: DLN
目的からご説明しますと...
私のPrimer Listの使い方がまちがっているかもしれませんが、Primer Listにあるプライマーの一覧を一括してエクセル等にリスト化したいです。PCR primer desigh を行った際に出てくるPrimer Listはcsvファイルで書き出すことができ、そこにはポジションに関する情報も含まれていますが、作成するプライマー数が多いと一つずつcsvファイルに書き出すのが大変です。PCR primer desighを行った際のリストの書き出しと同じような形で作成した複数のプライマーについて一括してcsvファイルの書き出しが行えるとありがたいです。もし、すでにこのようなことが行える機能があれば教えてください。
私のPrimer Listの使い方がまちがっているかもしれませんが、Primer Listにあるプライマーの一覧を一括してエクセル等にリスト化したいです。PCR primer desigh を行った際に出てくるPrimer Listはcsvファイルで書き出すことができ、そこにはポジションに関する情報も含まれていますが、作成するプライマー数が多いと一つずつcsvファイルに書き出すのが大変です。PCR primer desighを行った際のリストの書き出しと同じような形で作成した複数のプライマーについて一括してcsvファイルの書き出しが行えるとありがたいです。もし、すでにこのようなことが行える機能があれば教えてください。
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- akr
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06 1月 2011 10:02 #21
: akr
2つほど方法があります。これではいかがでしょうか?への返信 by akr
- 設計したPrimerをPrimer Listに登録すると、登録されているPrimerをカンマ区切りのフラットファイルで出力できます。これは、出力するPrimerを選択した後に、"Save as.."ボタンをクリックすることで実行できます。このファイルはCSV形式ファイルではありませんが、Excelに表形式で読み込むことができます。
- また、バッチPCR Primer Design機能やWhole Genome PCR Primer Design機能を使用して多数のプライマーを設計した場合には、Primer Listの左側を全部選択した後、右下のSelect The Best Primerをクリックし、さらにCSVボタンをクリックして出力します。
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