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IMC: フィーチャーをクリックしてその塩基配列範囲を指定したい

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19 10月 2010 07:43 #29 : akr
featureで規定されている場所から、そのほかの場所までを簡単に選択することができない。
例えば、feature map上で、CDSがあり、その場所をクリックして選択し、さらに、別の場所のプライマー(この二つの距離がたとえ5kp離れていても)をシフトを押しながら選択すると、その領域が選択でき、削除、コピーが自由自在にできる!という機能が欲しいです。

「2010/07/27 NS大Iさん」代理投稿しました。- Forum Administrator-

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19 10月 2010 07:44 #30 : akr
Version 4.1.31でご要望実装しました。

IMC Developer

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12 12月 2010 10:03 #31 : AgentUser
この機能でフィーチャーと配列のコピーはできますが、削除の方法が判りません。

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12 12月 2010 10:05 #32 : akr
上記の機能には、現在配列を含む全削除はありません(指定領域にオーバーラップするフィーチャーのみの削除は可能です)。
配列を含む全削除の場合は、一部オーバーラップするフィーチャーをどのようなフィーチャーキーとするか
取り決める必要があります。そのようなフィーチャーで、source以外はmisc_featureとする方法にしようかと考えています。

IMC Developer

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21 1月 2011 10:45 #33 : akr
IMC Version 4.2.15からフィーチャークリックによる指定範囲の塩基配列削除機能が追加されました。
  1. フィーチャーレーン上で操作を行います。
  2. コントロールキーを押しながら、指定したい範囲の左側のフィーチャーをクリックします。
  3. そのまま(コントロールキーを押しながら)、範囲の右端のフィーチャーをクリックします。
  4. 2つのフィーチャーを含む範囲の塩基配列が選択されます。
  5. 選択された範囲の上で、マウス右クリックします。
  6. メニューから「Delete Nucleotide」を選択します。
  7. 選択範囲にある全塩基配列およびその範囲に含まれるフィーチャーが削除されます。
  8. 範囲に一部がオーバーラップするフィーチャーはフィーチャーキーが変更される場合があります。
  9. 以上の処理は、保存ボタンをクリックすると、回復できません。

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