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この機能を実行するには、カレントゲノム配列に比較の基準となるゲノム配列1つをロードしておきます。

また、カレント参照ゲノムマップに比較する複数の近縁種ゲノム配列をロードしておきます。

広域ゲノム再配置マップ（GGRM）は、メニューあるいはツールボックスから起動できます。

操作

1. メニューのGenome Analysis -> Compare -> Global Genome Rearrangement Map...を選択します。あるいはLinkMapボタンをクリックします。
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3. ゲノム選択ダイアログが表示され、カレント参照ゲノム配列がリストに表示されます。
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5. 実際に比較するゲノムにチェックします（複数選択可能）。
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7. 核酸で比較するかアミノ酸で比較するかを選択します。
8. RUNをクリックします。
9. 実行確認メッセージが表示されます。
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11. 「はい（Y)」をクリックします。
12. 実行パラメータを詳細に設定したい場合は、Show Parameterをクリックすると表示されるパラメータ設定画面で設定します。
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14. 「はい」をクリックします。
15. 実行が開始されます。実行が開始されます。
16. 実行中は、進捗メッセージが表示されます。
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18. 実行時間はゲノムサイズや遺伝子数に比例します。
19. 実行が終了すると、結果表示ウィンドウが表示されます。
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21. スクロールボタンやズームボタン、リサイズを使用して移動、拡大を行います。
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