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IMC E03E 未登録の配列パターンを使って検索する

登録されていないパターンでパターン検索を行います。

予め、クリップボードに検索したい塩基配列をコピーしておきます。

操作

  1. クリップボードにある塩基配列パターンでフィーチャーマップに表示されている塩基配列上のパターンを検索します。
  2. 「Pattern Search」ボタンをクリックします。
  3. 「Pattern Search」Dialog が表示されます。
  4. 「Pattern」入力フィールドにカーソルを置き、「Ctrl-V」を押します。
  5. クリップボードから「Pattern」入力フィールドに塩基配列がペーストされます。
  6. 「Pattern Search」Dialog の下部にある「Search」ボタンをクリックします。
  7. 検索が実行される。実行中は「Pattern Matching..」プログレスメッセージが表示され、完了すると、「Pattern Match Sites」Window が表示されます。
  8. 左側には見つかったパターン名として自動的に生成された名称がつけられます。
  9. 左側のリストにチェックします。
  10. 右側に検索されたパターンが存在するフィーチャーマップ上の位置情報などが表示されます。
  11. 特定の行をクリックします。
  12. フィーチャーマップはその位置を表示し、かつ一致した塩基配列が青くカラー表示されます。

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