全配列データへの索引を１つのTaxonomy Tree上に展開するTaxiSpider作成日:2018年07月10日 | 最終更新日:2018年08月20日 | 印刷 | 参照数: 2289 TaxiSpiderは、iSpiderの姉妹ツールです。 塩基配列ファイルやアミノ酸配列ファイルへの全索引を指定したサイトからダウンロードするツールですが、それらの配列索引を1つの大きなTaxonomy Tree状のデータベースに格納していくことに特徴があります。 ダウンロードされた配列データはそのTaxonomy情報に従って、Taxonomy Treeの該当する枝上に格納されます。 ただし、ローカルに非常に大きなディスクスペースを必要とします。現在では、47GBのスペースが必要です。
ライセンス認証方法
ドングルライセンス（HWキー）
機能概要と基本操作
IMC操作の初歩
IMCの終了
ワークベンチ
ツールボックス
フィーチャーマップとレーン
配列・データ入出力
GenBank EMBLビューワ
配列ビューワ
アノテーションビューア
環状ゲノムマップビューワ
プラスミドマップビューア
トレース波形ビューア
分子系統樹ビューア
配列・注釈の検索
検索共通操作
フィーチャーキー検索
キーワード検索
パターン検索
バッチ（一括）ホモロジー検索
プライミング部位検索
制限酵素解析
プライマー設計
PCR反応
コンティグブリッジ
ライゲーション
プラスミドマップ操作
ゲル電気泳動
DNA断片修飾
相同組換処理
DNA組成解析
コドン解析
ORF解析
配列データベースの管理
ゲノム・遺伝子の比較
マルチプルアラインメント
多重環状ゲノムマップ
ドットプロット解析
ベンダイアグラム解析
逆相補鎖配列の生成
設定・インストール
インシリコアセンブラー
アイ・スパイダー(iSpider)
タクシースパイダー (TaxiSpider)
ARM
GenBank GBFF Expander
GenBankファイルチェッカー
