ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

準備

メインフィーチャーマップにVenn Diagramを描くために必要が３つのゲノムの１つをロードしてカレント配列とします。

さらに、MGV (参照ゲノムマップ) に2株以上の近縁種ゲノム塩基配列ファイルを読み込みます。

実行手順

メニューからGenome Analysis -> Compare -> Venn Diagram… を選択します。

Venn Diagram Setting ダイアログが表示されます。

Multiple Genome Viewer(MGV) MapにロードされているGenBankファイルが表示されます。

リストからVENN Diagramの対象ゲノムを２個までチェックします。

1個目のゲノムはメインフィーチャーマップのカレントゲノムとなります。

「Run ボタンをクリックします。

Venn Diagram 実行確認メッセージが表示されます。

Show Parameter… をクリックすると、実行確認ダイアログが拡大し、詳細パラメータが表示されます。

処理が終了するまで、ゲノムの大きさによっては、数分から数十分かかる場合があります。

実行中は進捗メッセージが表示されます。

処理が終了すると、結果画面が表示されます。

タブ切換操作

Venn Diagram 結果表示ダイアログは上部のタブで各ペインを切り替えます。

タブは全部で5個あります。

左から3個のタブは、2ゲノム間共通遺伝子リストです。

左から4個目のタブは、3ゲノム間共通遺伝子リストです。

最後のタブは、Venn Diagram 描画タブです。

結果表示ダイアログの上部タブをクリックすると、表示内容を切り替えることができます。

3ゲノム共通遺伝子リストの表示

２ゲノム間共通相同遺伝子リスト表示その１

２ゲノム間共通相同遺伝子リスト表示タブペイン　その２

 ２ゲノム間共通相同遺伝子リスト表示タブペイン　その３

Venn Diagram 描画タブペイン