ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

多重リニアゲノムマップ 上から実行できる機能には以下の機能があります。

• ホモロジー検索（核酸、アミノ酸）
  • リニアゲノムマップ 上の1つのCDSに対して リニアゲノムマップ の他のゲノムおよび メインフィーチャーマップ の カレント配列 の CDS に対して ホモロジー検索 を実行し、結果として多重リニアゲノムマップ でそのCDSを軸に ゲノムアラインメント を行います。
• 異種ホスト への組換用遺伝子組成変更機能
  • リニアゲノムマップ 上の1つのCDSを、メインフィーチャーマップの カレントゲノム の相同な遺伝子に置き換えます。このとき、Codon Adoptation Index にもとづき、組換遺伝子 の組成を自動的に変更します。
• 遺伝子クラスターアラインメント
  • リニアゲノムマップ 上の１つのCDSに関して、上流下流のCDSを含めて、多重リニアゲノムマップ上の他のゲノムとの遺伝子クラスター比較を行い、クラスターアラインメント を行います。
• 自動アノテーション
  • リニアゲノムマップ を参照ゲノムとして、メインフィーチャーマップ の カレントゲノム に 自動アノテーション を実行します。