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• PCR プライマーセットをメインフィーチャーマップの配列レーンの塩基配列上から登録します。

登録操作

1. テンプレートとなる塩基配列をメインカレントディレクトリ―にロードします。
2. ロードされた配列がメインフィーチャーマップに表示されます。
3. 
4. メインフィーチャーマップに配列レーンが表示されていない場合は、配列レーンをメインフィーチャーマップに追加します。
5. PCR 増幅したい領域の上流側のPlus Strand 上の塩基配列をマウスでドラッグします。
6. ドラッグされた塩基配列が赤く反転表示されます。
7. 
8. 塩基配列上で、マウスを右クリックします。
9. ポップアップメニューが表示されます。
10. 
11. メニューから「Save as a Primer」をクリックします。
12. 「Primer Registration」ダイアログ が表示されます。
13. 
14. 「Primer ID」にユニークな名称を入力します（デフォールトではprimer+塩基位置番号が設定されます）。
15. 「Primer Sequence」にはコピーされた塩基配列が大文字で自動的にペーストされています。
16. 「Comment」欄には自由に記述できます。
17. 「Save」をクリックします。
18. Forward プライマーが登録されます。
19. 同様に Reverse Primer を登録します。
20. Reverse primer の場合は配列レーンのPCR増幅予定領域の下流の Minus Strand　をマウスでドラッグします。

登録されたプライマーの確認操作

1. メニューからCloning -> Primer Design -> PCR Primer Registration をクリックします。
2. Priming Site Search Window が表示されます。
3. ここには、さきほど登録したプライマーが配列や、Tm、GC 含量などとともに表示されています。
4. 最近登録されたプライマーはリストの一番下にあります。
5.