IMC i02A 配列レーン上からのプライマー登録作成日:2020年03月02日 | 最終更新日:2020年03月02日 | 印刷 | 参照数: 976 PCR プライマーセットをメインフィーチャーマップの配列レーンの塩基配列上から登録します。 登録操作 テンプレートとなる塩基配列をメインカレントディレクトリ―にロードします。 ロードされた配列がメインフィーチャーマップに表示されます。 メインフィーチャーマップに配列レーンが表示されていない場合は、配列レーンをメインフィーチャーマップに追加します。 PCR 増幅したい領域の上流側のPlus Strand 上の塩基配列をマウスでドラッグします。 ドラッグされた塩基配列が赤く反転表示されます。 塩基配列上で、マウスを右クリックします。 ポップアップメニューが表示されます。 メニューから「Save as a Primer」をクリックします。 「Primer Registration」ダイアログ が表示されます。 「Primer ID」にユニークな名称を入力します(デフォールトではprimer+塩基位置番号が設定されます)。 「Primer Sequence」にはコピーされた塩基配列が大文字で自動的にペーストされています。 「Comment」欄には自由に記述できます。 「Save」をクリックします。 Forward プライマーが登録されます。 同様に Reverse Primer を登録します。 Reverse primer の場合は配列レーンのPCR増幅予定領域の下流の Minus Strand をマウスでドラッグします。 登録されたプライマーの確認操作 メニューからCloning -> Primer Design -> PCR Primer Registration をクリックします。 Priming Site Search Window が表示されます。 ここには、さきほど登録したプライマーが配列や、Tm、GC 含量などとともに表示されています。 最近登録されたプライマーはリストの一番下にあります。 前へ 次へ