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IMC W723 Venn Diagram タブペインの説明

Venn Diagram タブペインでは、Venn Diagram の描画のための パラメータ を設定します

Color セクション:

Venn Diagram の 描画カラー を変更できます。

カラーボックス 1 :最初の円の 塗りカラー を設定します。

カラーボックス 2 :第二の円の塗りカラーを設定します。

カラーボックス 3 :第三の円の塗りカラーを設定します。

Label カラーボックス :各円の内部に描くラベルのカラーを指定します。

Qualifier セクション:

Venn Diagram の 結果リストダイアログ に表示する Qualifier を各 プルダウンメニュー から3つまで選択します。

Condition セクション:Venn Diagram では、2つあるいは3つのゲノムに共通な遺伝子を判定します。判定に際しては、BBH (Best Binary Hit)を使用します。BBHとなる遺伝子ペアあるいは トリプレット を採用するか否かの判定は以下の条件を使用します。

Percent Identity テキストフィールド:正の実数値を入力します。2つあるいは3つの BBH のアラインメント領域におけるアミノ酸 配列一致度 をパーセンテージで指定します。

Overlap Ratio テキストフィールド:正の実数値を入力します。2つあるいは3つの BBH のアラインメント領域の残基長が全長に占める割合をパーセンテージで指定します。

Feature Setting 共通操作ボタンについてはこちらをご覧ください。

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