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3ゲノム間のVenn Diagramを構成する共通遺伝子およびユニーク遺伝子のリストです。

全部で7個のリストから構成されており、これは３ゲノム間Venn Diagram の7個の領域に対応しています。

• 3ゲノム間の共通遺伝子リスト(下の画面のBi-Directional Hit)(遺伝子数)
• ゲノム１で、ゲノム２、３に対してユニークな遺伝子リスト(No Hit NC_002179)(遺伝子数)
• ゲノム２で、ゲノム３、１に対してユニークな遺伝子リスト(No Hit NC_000922)(遺伝子数)
• ゲノム３で、ゲノム１、３に対してユニークな遺伝子リスト(No Hit NC_002491)(遺伝子数)
• ゲノム１とゲノム２の間で共通で、ゲノム３には共通遺伝子をもたない遺伝子リスト(NC_002179-NC_000922)(遺伝子数)
• ゲノム２とゲノム３の間で共通で、ゲノム１には共通遺伝子をもたない遺伝子リスト(NC_000922-NC_002491)(遺伝子数)
• ゲノム３とゲノム１の間で共通で、ゲノム２には共通遺伝子をもたない遺伝子リスト(NC_002491-NC_002179)(遺伝子数)

項目説明

3ゲノム間共通遺伝子リスト

• No. : ゲノム１上の上流から数えた共通あるいはユニーク遺伝子の連番

ゲノム１

• gene : ゲノム１上の遺伝子に注釈された遺伝子名
• locus_tag　: その遺伝子に注釈づけられたlocus_tag
• protein_id : 例。この表示項目はQualifierリストから自由に選択できます
• Start : この共通遺伝子に属するゲノム１上の遺伝子の開始位置
• End : この共通遺伝子に属するゲノム１上の遺伝子の終了位置
• Strand : この共通遺伝子に属するゲノム１上の遺伝子が乗っている
• StrandIdentity : ゲノム１とゲノム２の遺伝子間のアミノ酸残基一致度

ゲノム２

• gene : ゲノム２上の遺伝子に注釈された遺伝子名。
• locus_tag : ゲノム２上の遺伝子に注釈づけられたlocus_tag。
• protein_id : 例。この表示項目はQualifierリストから自由に選択できます。
• Start : この共通遺伝子に属するゲノム２上の遺伝子の開始位置
• End : この共通遺伝子に属するゲノム２上の遺伝子の終了位置
• Strand : この共通遺伝子に属するゲノム２上の遺伝子が乗っているStrand
• Identity : ゲノム２とゲノム３の遺伝子間のアミノ酸残基一致度

ゲノム３

• gene : ゲノム３上の遺伝子に注釈された遺伝子名。
• locus_tag : ゲノム３上の遺伝子に注釈づけられたlocus_tag。
• protein_id : 例。この表示項目はQualifierリストから自由に選択できます。
• Start : この共通遺伝子に属するゲノム３上の遺伝子の開始位置
• End : この共通遺伝子に属するゲノム３上の遺伝子の終了位置
• Strand : この共通遺伝子に属するゲノム３上の遺伝子が乗っているStrand
• Identity : ゲノム３とゲノム１の遺伝子間のアミノ酸残基一致度

操作ボタン

• CSV… ボタン ： リストをCSV形式でファイル出力します
• Save…　ボタン ： 解析結果すべてを再ロードできる状態でファイル保存します
• Close… ボタン ： ダイアログを閉じます。解析結果は保存されません