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IMC W552 ベン・ダイアグラム 3ゲノム間共通遺伝子リストタブペイン

3ゲノム間のVenn Diagramを構成する共通遺伝子およびユニーク遺伝子のリストです。

全部で7個のリストから構成されており、これは3ゲノム間Venn Diagram の7個の領域に対応しています。

  • 3ゲノム間の共通遺伝子リスト(下の画面のBi-Directional Hit)(遺伝子数)
  • ゲノム1で、ゲノム2、3に対してユニークな遺伝子リスト(No Hit NC_002179)(遺伝子数)
  • ゲノム2で、ゲノム3、1に対してユニークな遺伝子リスト(No Hit NC_000922)(遺伝子数)
  • ゲノム3で、ゲノム1、3に対してユニークな遺伝子リスト(No Hit NC_002491)(遺伝子数)
  • ゲノム1とゲノム2の間で共通で、ゲノム3には共通遺伝子をもたない遺伝子リスト(NC_002179-NC_000922)(遺伝子数)
  • ゲノム2とゲノム3の間で共通で、ゲノム1には共通遺伝子をもたない遺伝子リスト(NC_000922-NC_002491)(遺伝子数)
  • ゲノム3とゲノム1の間で共通で、ゲノム2には共通遺伝子をもたない遺伝子リスト(NC_002491-NC_002179)(遺伝子数)

項目説明

3ゲノム間共通遺伝子リスト

  • No. : ゲノム1上の上流から数えた共通あるいはユニーク遺伝子の連番

ゲノム1

  • gene : ゲノム1上の遺伝子に注釈された遺伝子名
  • locus_tag : その遺伝子に注釈づけられたlocus_tag
  • protein_id : 例。この表示項目はQualifierリストから自由に選択できます
  • Start : この共通遺伝子に属するゲノム1上の遺伝子の開始位置
  • End : この共通遺伝子に属するゲノム1上の遺伝子の終了位置
  • Strand : この共通遺伝子に属するゲノム1上の遺伝子が乗っている
  • StrandIdentity : ゲノム1とゲノム2の遺伝子間のアミノ酸残基一致度

ゲノム2

  • gene : ゲノム2上の遺伝子に注釈された遺伝子名。
  • locus_tag : ゲノム2上の遺伝子に注釈づけられたlocus_tag。
  • protein_id : 例。この表示項目はQualifierリストから自由に選択できます。
  • Start : この共通遺伝子に属するゲノム2上の遺伝子の開始位置
  • End : この共通遺伝子に属するゲノム2上の遺伝子の終了位置
  • Strand : この共通遺伝子に属するゲノム2上の遺伝子が乗っているStrand
  • Identity : ゲノム2とゲノム3の遺伝子間のアミノ酸残基一致度

ゲノム3

  • gene : ゲノム3上の遺伝子に注釈された遺伝子名。
  • locus_tag : ゲノム3上の遺伝子に注釈づけられたlocus_tag。
  • protein_id : 例。この表示項目はQualifierリストから自由に選択できます。
  • Start : この共通遺伝子に属するゲノム3上の遺伝子の開始位置
  • End : この共通遺伝子に属するゲノム3上の遺伝子の終了位置
  • Strand : この共通遺伝子に属するゲノム3上の遺伝子が乗っているStrand
  • Identity : ゲノム3とゲノム1の遺伝子間のアミノ酸残基一致度

操作ボタン

  • CSV… ボタン : リストをCSV形式でファイル出力します
  • Save… ボタン : 解析結果すべてを再ロードできる状態でファイル保存します
  • Close… ボタン : ダイアログを閉じます。解析結果は保存されません

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