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IMC W553 ベン・ダイアグラム 2ゲノム共通およびユニーク遺伝子リストタブペイン

2ゲノム間共通およびユニーク遺伝子リストは3種類作成され、それぞれのタブをクリックすることで開くことができます。

  • 2ゲノム間の共通遺伝子リスト(下の画面のBi-Directional Hit)(遺伝子数)
  • ゲノム1で、ゲノム2に対してユニークな遺伝子リスト(No Hit NC_002179)(遺伝子数)

  • No. : ゲノム1上の上流から数えた共通あるいはユニーク遺伝子の連番

ゲノム1

  • gene : ゲノム1上の遺伝子に注釈された遺伝子名
  • locus_tag : その遺伝子に注釈づけられたlocus_tag
  • protein_id : 例。この表示項目はQualifierリストから自由に選択できます
  • Start : この共通遺伝子に属するゲノム1上の遺伝子の開始位置
  • End : この共通遺伝子に属するゲノム1上の遺伝子の終了位置
  • Strand : この共通遺伝子に属するゲノム1上の遺伝子が乗っているStrand
  • Identity : ゲノム1とゲノム2の遺伝子間のアミノ酸残基一致度

ゲノム2

  • gene : ゲノム2上の遺伝子に注釈された遺伝子名
  • locus_tag : ゲノム2上の遺伝子に注釈づけられたlocus_tag
  • protein_id : 例。この表示項目はQualifierリストから自由に選択できます
  • Start : この共通遺伝子に属するゲノム2上の遺伝子の開始位置
  • End : この共通遺伝子に属するゲノム2上の遺伝子の終了位置
  • Strand : この共通遺伝子に属するゲノム2上の遺伝子が乗っているStrand

 

操作ボタン

  • CSV… ボタン : リストをCSV形式でファイル出力します
  • Save… ボタン : 解析結果すべてを再ロードできる状態でファイル保存します
  • Close… ボタン : ダイアログを閉じます。解析結果は保存されません

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