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予め、検索するアミノ酸配列パターンを登録しておくか、クリップボードにコピーしておきます。

クリップボードにコピーされているアミノ酸パターンでフィーチャーマップ上の全CDS 上のアミノ酸配列を検索します。

操作

1. 「Pattern Search」ボタンをクリックします。
2. 「Pattern Search」Window が表示されます。
3. 「Pattern」フィールドにクリップボードから「Ctrl-V」でアミノ酸配列をペーストします。
4. 「Range」フィールドの「CDS」にチェックする。
5. 「Search」ボタンをクリックします。
6. 検索が開始され、検索中はプログレスメッセージが表示されます。
7. 検索が終了すると、「Pattern Match Sites」Window が表示されます。
8. 左側にはパターンごとのマッチしたパターン数が表示されます。
9. 左側のパターンにチェックします。
10. 右側のリストに実際に発見されたすべてのパターン位置が表示されます。
11. １つの行をクリックすると、フィーチャーマップはその位置をただちに表示し、マッチしたアミノ酸配列もカラーで区別されます。