カレントゲノム配列のGCコンテントや、GCスキューなどのプロファイル(複数指定可)を独立したウィンドウに描きます。
ゲノム塩基長の異なる複数のゲノムの異なる複数プロファイルを1枚のキャンバス上に描きます。
操作
メインカレントディレクトリにコンテント・プロファイルを描画する対象のゲノム配列をロードし、選択(複数選択可能)します。
メニューから「Genome Analysis -> Genome Info -> Show Content/Profile Graph」をクリックします。
(IMC Version 7.30 までは 「File -> Save Content/Profile..」をクリックします)
「Content/Profile Graph Setting」ダイアログが表示されます。
「Show Parameter」をクリックすると、ダイアログが拡大され、パラメータ設定領域が表示されます。
「Hide Parameter」をクリックすると、パラメータ設定領域が隠されます。
「Add」をクリックします。
「Add Content/Profile Data」ダイアログが表示されます。
「Data」プルダウンメニューから、ゲノムを選択します。
「Type」プルダウンメニューから、描画するコンテント・プロファイルを選択します。
「Color」ボックスをクリックして、描画カラーを選択します。
「Set」をクリックします。
「Content/Profile Graph Setting」ダイアログに描画するコンテント・プロファイルが追加されます。
他のコンテント・プロファイルを追加します。
「Show]をクリックします。
処理が開始されます。
実行中は進捗メッセージが表示されます。
処理が完了すると、「Content/Profile Graph」ウィンドウが表示され、指定したコンテント・プロファイルが描画されています。
この画像は、ファイル保存することができます。
コンテント・プロファイルはいくつでも追加できます。
異なるゲノムのコンテント・プロファイルも同一画面に描画できます。