IMC の フィーチャーマップ は多様なカスタマイズ機能(フィーチャーレイアウトスタイル対応)を有しており、望み通りの遺伝子地図などを描画、印刷することができます。
遺伝子地図 (フィーチャーマップ)作成、地図のカスタマイズ(フィーチャー配置方法、形状、カラー、ラベル)
独自フィーチャーキーの登録
環状DNA 対応のスクロール、地図描画
高速ズーム、スクロール、ナビゲーションレーン
GenBank/EMBL フォーマットファイルとの連動
コンテントマップ(組成ファイル)のグラフ描画・印刷
フィーチャーレイアウトスタイルを使用することにより、複数の機能別レーンを組み合わせてフィーチャーマップを描画する際に予め登録したレイアウトを適用することにより、簡単に複雑なフィーチャーレイアウトをもつフィーチャーマップを描画することができます。
配列レーンには、現在ロードされている塩基配列ファイルの塩基および、もしそこがコーディング領域である場合はアミノ酸配列がそれぞれストランド別に表示されます。
配列レーンはフィーチャーマップのどの位置にも配置することができます。必要であれば2個以上の配列レーンを1つのフィーチャーマップ上に配置できます。
塩基4種類とアミノ酸20種類はそれぞれ個別に異なるカラーで表示することができます。
描画カラーおよびフォントサイズの変更は、フィーチャーセッティングのSequence Lane タブペインで行います。
アミノ酸1文字コードをコドンのどの位置に置くかを変更することができます。
スタートコドン候補やストップコドンの位置を示す矩形をフレーム表示領域に表示できます。
フォントタイプの変更はできません。
コンテント・プロファイルレーンは、塩基組成などの数値をスライディングウィンドウ手法を用いて、それらのプロファイルを表示するためのレーンです。
コンテント・プロファイルレーンに表示できる登録済プロファイルは以下の通りです。
Navigation Laneは、Feature Map全体の鳥瞰地図を表示し、スライダでFeature Mapの表示位置を移動することができます。
局所ゲノム再配置マップレーン(LGRMレーン)は、局所ゲノム再配置マップをメインフィーチャーマップ上に 描画するためのレーンです。
2株の近縁株の間の塩基単位での変異を表示します。
このレーンには、変異リストダイアログが連動しています。
実装エディション
IMCGE, IMCAE, IMCDS, GT
発現プロファイルレーンは、タイリングアレイやRNA-Seqによる発現データをグラフ表示するためのレーンです。
実装エディション
IMCAE, IMCDS, GT
メインフィーチャーマップには複数の発現プロファイルレーンを登録・表示でき、1つのフィーチャーマップ上に登録・表示できるレーン数には制限がありません。
表示レーン数が多くなると縦スクロールする必要があります。
レーンはゲノム位置に依存する発現量を棒グラフあるいは折れ線グラフで表示できます。
レーン毎に表示や計算の設定を変えることができます。
縦スクロールバーレーン
配列スケールレーンとマップスケールレーン