ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

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ローカルパスウェイビルダーは、ロードされたゲノムスケールモデルに記載された情報を使用して、代謝パスウェイを1反応ずつ伸長していくツールです。

 IMC8109 245 0013

IMC Version 8.109 から実装されています。

ローカルパスウェイビルダー(PLPB)上で操作可能な機能

  • ズーム操作
  • パスウェイ画像のファイル保存(SVG,PNG) (PEのみ)
  • ノード(Reaction, Metabolite)の除去
  • ノードの移動
  • 描画されたパスウェイを消す
  • レイアウトスタイルの変更
  • パスウェイの左右反転、上下反転、±90℃回転
  • CoFacotrノードの結合、結合解除

 

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